El Dr. Fernández desarrolló trabajo de investigación post-doctoral en la Escuela de salud Pública de la Universidad de Harvard, y tiene experiencia como consultor tanto en el sector privado como en el público, en instituciones tales como la Organización Mundial de la Salud (OMS), y el Programa de Naciones Unidas para el Medio Ambiente (PNUMA).
Desde 1995, el Dr. Fernández ha ocupado importantes puestos en la Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales, primero como Director General de Gestión e Información Ambienta, y más recientemente como Director General de Investigación sobre Contaminación Urbana, Regional y Global, ambos en el Instituto Nacional de Ecología. Desde marzo de 2005, desempeña el cargo de Presidente del Instituto Nacional de Ecología.
Es Licenciado en Biología, con área de concentración en Ecología por la Universidad Autónoma Metropolitana. En 1989 completó la Maestría en Tecnología Ambiental (MSc) en el Colegio Imperial de Ciencia, Tecnología y Medicina de la Universidad de Londres. En 1993 obtuvo el Doctorado (PhD) en Ciencias Ambientales (PhD) por la misma universidad con la Tesis : “ Commuters Exposure to CO in the Metropolitan Area of Mexico City ”. Este trabajo fue pionero en su tipo en México, al evaluar la exposición real de la población a los contaminantes por medio del uso de monitores personales mientras se transportan en la ciudad. Como resultado de estas investigaciones se publicaron varios artículos científicos en Atmospheric Environment y el Journal of Exposure Análisis and Environmental Epidemiology, así como reseñas periodísticas y divulgación de resultados por grupos ambientalistas como Greenpeace.
El Dr. Fernández ha sido consultor o asesor en actividades del Banco Mundial, el Programa de las Naciones Unidas para el Ambiente y la Organización Mundial de la Salud. Con esta última institución colaboró también en la elaboración del libro: Urban Air Pollution in Megacities of the World (1991). Ha sido becario del Consejo Británico y del CONACYT. De 1990 a 1993 fue recipiente de la Overseas Research Student Award otorgada en el Reino Unido a estudiantes extranjeros destacados. En 1993, obtuvo la prestigiosa beca Robert McNamara del Banco Mundial para realizar investigaciones postdoctorales en la Escuela de Salud Pública de la Universidad de Harvard.
Durante su estancia en Boston, impartió clases a nivel de posgrado en la Escuela de Gobierno J.F. Kennedy de la U. de Harvard, en la cual también tomó cursos sobre Análisis de Negociaciones y Resolución de Conflictos. Por sus tareas de investigación recibió reconocimientos por escrito del Gobernador de Massachusetts y del Alcalde de Boston. En el 2000, la International Society for Exposure Análisis otorgó al Dr. Fernández su premio anual Young Scientist Award por su trayectoria profesional en este campo y en ese mismo año, la US Environmental Protection Agency le entregó la Bronze Medal for Commendable Service , por sus aportaciones al Programa Frontera XXI desempeñandose de 1997 al 2000 como Presidente de cuatro grupos binacionales de trabajo.
Desde 1997 a la fecha, el Dr. Fernández participa cada año como Profesor Invitado por la Escuela de Salud Pública de la Universidad de Harvard (HSPH) para impartir cursos de verano de forma alternada en Boston, Berna y Moscú, junto con otros profesores de la misma Universidad. Actualmente continúa vigente su estatus como Instructor dentro del Departamento de Salud Ambiental de la propia HSPH y ha sido miembro del Comité Asesor del Harvard Center for Risk Analysis. En México ha dado clases en la Universidad de las Americas y en la Universidad Nacional Autónoma de México. Además, ha impartido conferencias y cursos en programas de especialización y posgrado del Colegio de México (Programa LEAD), del Instituto Politécnico Nacional, Programa Universitario del Medio Ambiente, Universidad Autónoma Metropolitana, Universidad Iberoamericana, el Instituto Tecnológico Autónomo de México y el Instituto Tecnológico de Estudios Superiores de Monterrey.
De 1995 al 2000, encabezó la Dirección General de Gestión e Información Ambiental (DGGIA) en el Instituto Nacional de Ecología, del Gobierno Federal, área responsable del establecimiento de políticas y normas sobre contaminación del aire a nivel nacional. Durante ese período, la DGGIA elaboró las bases para el primer Registro de Emisiones y Transferencia de Contaminantes y los primeros reportes sobre Indicadores Ambientales elaborados en México (“Avances en el Desarrollo de Indicadores para la Evaluación del Desempeño Ambiental de México” - en 1997; e “ Indicadores para la Evaluación del Desempeño Ambiental – 2000” ).
Durante el mismo período coordinó la elaboración de los primeros programas de calidad del aire para las ciudades de Guadalajara, Monterrey, Cd. Juárez, Toluca, Mexicali y Tijuana. De igual forma, fue responsable de la coordinación del “ Reporte del Estado Ambiental y de los Recursos Naturales en la Frontera Norte de México ” y co-responsable del reporte binacional “ Indicadores Ambientales para la Frontera México-Estados Unidos ” (1999). Dirigió la elaboración y publicación de 3 reportes de calidad del aire y del primer “ Almanaque de Datos y Tendencias de la Calidad del Aire en Ciudades Mexicanas ” (2000).
También de 1995 al 2000 representó a semarnat ante la Comisión Ambiental Metropolitana del Valle de México (CAM), donde participó activamente en la elaboración de los programas de Calidad del Aire de la Ciudad de México 1995-2000 y el 2002-2010. Dentro de la misma CAM, actualmente es responsable de la Supervisión Técnica de los Proyectos de investigación que viene realizando en México el Dr. Mario Molina del Instituto Tecnológico de Massachusetts desde 2001.
En 1996 fue responsable de negociar con la Agencia de Cooperación Internacional del Japón (JICA) y con la Universidad Autónoma Metropolitana el diseño, construcción y operación del Centro Nacional de Investigación y Capacitación Ambiental o CENICA , el cual hoy forma parte del Instituto Nacional de Ecología. Las donaciones que se obtuvieron para equipamiento de los laboratorios de CENICA superan los 5 millones de dólares. Actualmente, el CENICA se constituye como el laboratorio más moderno en su tipo en Latinoamérica. Como parte de la interacción con JICA, el Dr. Fernández participó en dos ocasiones en programas de entrenamiento para directivos en el Japón.
En 1997 encabezó las negociaciones de semarnat con la Asociación Mexicana de la Industria Automotriz para lograr que en México los automóviles nuevos a partir de 1999 cumplieran con estándares de emisión de contaminantes tan estrictos como los aplicados en EUA (TIER I).
Es evaluador de Proyectos Ambientales y de becarios al extranjero del CONACYT; ha evaluado artículos para revistas especializadas como la “ Air and Waste Management Association ” y “ Risk Análisis ”. Desde el 2000 el Dr. Fernández es miembro del Panel Internacional de Expertos del California Air Resources Board que evalúa la instrumentación de programas de control de la contaminación; y también forma parte del International Council for Clean Transportation , una asociación auspiciada por la Fundación Hewlett que reúne a una docena de expertos de varias partes del mundo.
De 1995 al 2002 el Dr. Fernández representó a semarnat como delegado ante el grupo de Evaluación del Desempeño Ambiental de la Organización para la Cooperación y el Desarrollo Económico (OCDE). Desde el 2001 participa activamente en el grupo de Expertos de Cambio Climático de la misma OCDE. Es representante del Gobierno Mexicano en el Consejo Ejecutivo de la North American Research Inititative for Tropospheric Ozone (NARSTO).
En el verano de 1998 diseñó y organizó el curso de verano: “ Environmental Management and Policy ” impartido en la Escuela de Gobierno J.F. Kennedy de la U. de Harvard, para altos directivos de la semarnat . Este curso sirvió como piloto para el diseño y creación en el 2002 del Programa de Maestría mid-career “ Environmental and Health Management ” lanzado por INE-MIT-Harvard, y del cual el Dr. Fernández es coordinador. Este programa permite brindar capacitación de alto nivel a mandos medios y superiores de la semarnat
Desde enero del 2001 hasta febrero de 2005 tuvo a su cargo la Dirección General de Investigación sobre la Contaminación Urbana , Regional y Global del INE, unidad responsable de promover y coordinar actividades de investigación sobre Contaminación del Aire, Cambio Climático y Contaminantes Orgánicos Persistentes a nivel nacional.
Desde esta posición, en el tema de la contaminación del aire ha sido responsable de coordinar estudios pioneros sobre (1) cobeneficios locales y globales del control de la contaminación; (2) evaluación de los riesgos en salud causados por las emisiones de plantas termoeléctricas en México; (3) evaluación de costo-efectividad y de beneficios resultantes de la introducción de combustibles de bajo azufre; y (4) participar en el desarrollo de una propuesta para incentivar vehículos más eficientes en México incluyendo una investigación de campo en 2002 sobre el desempeño de automóviles híbridos Prius en nuestro país.
Con respecto al área de Sustancias Tóxicas, Presidió durante el período 2002-2003 el grupo de Manejo Adecuado de Sustancias Químicas de America del Norte, lidereando con su grupo la eliminación del uso del Lindano en México y la publicación de los libros “Introducción a la Evaluación de Riesgos Ambientales” en 2003 y “Las Sustancias Tóxicas Persistentes en México” en 2004.
En materia de cambio climático, coordinó los esfuerzos para la publicación en 2001 de la Segunda Comunicación Nacional de México ante las Naciones Unidas lo que permitió que nuestro país fuera el primer país no-anexo I en cumplir con este compromiso. Actualmente promueve el fortalecimiento de las capacidades científicas de México para realizar estudios de mitigación, vulnerabilidad y adaptación al cambio climático, incluyendo la preparación de un Inventario Nacional de Gases de Efecto Invernadero y de la Tercera Comunicación Nacional de Cambio Climático. En Julio de 2004 fue elegido Presidente del Consejo Ejecutivo del Instituto Interamericano de Investigación sobre Cambio Global (IAI) y además funge actualmente como Punto Focal del IPCC en México. A principios de 2005 concluyó la coedición del libro “Cambio Climático: Una Visión desde México” en el que participan mas de 30 expertos mexicanos en la materia.
Durante los tres últimos años ha apoyado al Dr. Mario Molina en el diseño y constitución del Centro Mario Molina para Estudios Estratégicos sobre Energía y Medio Ambiente A.C., inaugurado en noviembre de 2004 y con quien el INE realiza proyectos de investigación de manera conjunta.
A partir de Marzo del 2005 fue designado Presidente del Instituto Nacional de Ecología.
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